=============================================================== Results of Searching the Databases for Intrafamily Similarities =============================================================== The expectation values you see here are the results of multiple sequence similarity searches. Once I get a good expectation for a sequence (below the Prosite suggested e-4 threshold and within reason - the sequence cannot merely be compared favorably to itself or to a small clique of sequences to which no other family members are related), I consider the sequence "related" and do not bother updating its expectation values for subsequent searches. Search Characteristics Num Program Format Database Sequence Options -------------------------------------------------- (1) BLAST DNA GenBank CATL_HUMAN (2) FASTA DNA GenBank CATL_HUMAN (3) FASTA Protein PIR CYSP_PLAFA (4) FASTA Protein PIR CATL_HUMAN SwissProt Expectation Values Identifier GenBank P I R ------------------------------------------------ A494_ARATH -- -- (3)2.4e-08 -- ACP1_ENTHI -- -- (3)9.8e-10 -- ACP2_ENTHI -- -- (3)9.8e-10 -- ACTN_ACTCH -- -- (3)5.1e-13 -- ALEU_HORVU -- -- (3)3.5e-14 -- BROM_ANACO -- -- (3)1.1e-15 -- CAT3_FASHE -- -- -- CATB_BOVIN -- -- (4)7.4e-07 -- CATB_CHICK -- -- (4)2.2e-05 -- CATB_HUMAN -- -- (4)9.6e-08 -- CATB_MOUSE -- -- (4)6.5e-07 -- CATB_RAT -- -- (4)1.3e-07 -- CATC_HUMAN -- -- -- CATC_RAT -- -- -- CATH_HUMAN -- (2)2.8e-14 -- (3)2.2e-14 -- DONE CATH_MOUSE -- (2)3.5e-15 -- -- CATH_RAT -- -- (3)4e-13 -- CATK_HUMAN -- (1)6e-11 -- (3)6.4e-16 -- DONE CATK_MOUSE -- (1)4e-09 -- -- CATK_RABIT -- (1)9e-07 -- (3)4.1e-17 -- DONE CATL_BOVIN -- (1)e-128 -- -- CATL_CHICK -- -- (3)2.2e-13 -- CATL_FELCA -- (1)2e-32 -- (4)1.3e-37 -- DONE CATL_HUMAN -- (1)search -- (3)3.6e-17 -- DONE CATL_MOUSE -- (1)1e-39 -- (3)8.4e-16 -- DONE CATL_RAT -- (1)2e-60 -- (3)7.4e-16 -- DONE CATL_SHEEP -- -- -- CATO_HUMAN -- -- (3)3e-13 -- CATS_BOVIN -- (2)8.3e-26 -- (3)7.1e-15 -- DONE CATS_HUMAN -- (2)1.5e-14 -- (3)4.6e-15 -- DONE CATS_RAT -- (2)5.2e-39 -- (3)3.2e-10 -- DONE CATV_NPVAC -- -- (3)1.2e-11 -- CATV_NPVBM -- -- (3)1.6e-12 -- CATV_NPVCF -- -- (3)3.6e-12 -- CATX_BOVIN -- -- -- CC1_CARCN -- -- -- CC2_CARCN -- -- -- CC3_CARCN -- -- (3)9.1e-15 -- CC4_CARCN -- -- -- CPP1_ENTHI -- -- -- CPP2_ENTHI -- -- -- CPP3_ENTHI -- -- (3)9.8e-10 -- CPR3_CAEEL -- -- -- CPR4_CAEEL -- -- -- CPR5_CAEEL -- -- -- CPR6_CAEEL -- -- -- CYS1_CAEEL -- -- -- CYS1_DICDI -- -- (3)3.7e-10 -- CYS1_HAECO -- -- (4)3e-05 -- CYS1_HOMAM -- -- (3)1.7e-11 -- CYS1_HORVU -- -- (3)2.4e-14 -- CYS1_LEIPI -- -- (3)1.2e-13 -- CYS1_MAIZE -- -- (3)1.8e-08 -- CYS1_OSTOS -- -- (4)1.6e-05 -- CYS2_DICDI -- -- (3)3.9e-15 -- CYS2_HAECO -- -- (4)2.5e-05 -- CYS2_HOMAM -- -- (3)3.9e-13 -- CYS2_HORVU -- -- (3)2.4e-14 -- CYS2_LEIPI -- -- (3)1.2e-13 -- CYS2_MAIZE -- -- (3)4.2e-11 -- CYS3_HOMAM -- -- (3)1.4e-13 -- CYS3_OSTOS -- -- (4)1.9e-05 -- CYS4_BRANA -- -- (3)2e-13 -- CYS4_DICDI -- -- -- CYS5_DICDI -- -- -- CYSL_LYCES -- -- (3)4e-16 -- CYSP_HEMSP -- -- (3)3.1e-16 -- CYSP_PEA -- -- (3)9.8e-10 -- CYSP_PHAVU -- -- (3)8.5e-17 -- CYSP_PLAFA -- (5)search -- (3)search -- CYSP_PLAVI -- -- (3)4.6e-83 -- CYSP_PLAVN -- -- (3)1.7e-68 -- CYSP_SCHJA -- -- -- CYSP_SCHMA -- -- (4)1.2e-07 -- CYSP_THEAN -- -- (3)2.5e-21 -- CYSP_THEPA -- -- (3)2.7e-17 -- CYSP_TRIFO -- -- (3)2.1e-08 -- CYSP_TRYBB -- -- (3)5.7e-11 -- CYSP_TRYCR -- -- -- CYSP_VIGMU -- -- (3)4.1e-16 -- EUM1_EURMA -- -- (3)1.4e-06 -- LCPA_LEIME -- -- (3)6.9e-09 -- LCPB_LEIME -- -- (3)7.1e-14 -- MMAL_DERFA -- -- (3)4.2e-07 -- MMAL_DERPT -- -- (3)2.7e-06 -- ORYA_ORYSA -- -- (3)2.4e-15 -- ORYB_ORYSA -- -- (3)1.7e-15 -- ORYC_ORYSA -- -- (3)1.3e-11 -- P34_SOYBN -- -- (3)4.1e-10 -- PAP2_CARPA -- -- (3)7.1e-15 -- PAP3_CARPA -- -- (3)3.8e-17 -- PAP4_CARPA -- -- (3)3e-16 -- PAP5_CARPA -- -- (4)1.9e-08 -- PAPA_CARPA -- -- (3)1.9e-15 -- RD19_ARATH -- -- -- RD21_ARATH -- -- -- SERA_PLAFG -- -- (4)4e-05 -- TES1_RAT -- (2)1.3e-113-- (3)8.1e-12 -- DONE THPA_THADA -- -- --